Protein–RNA interactions for Protein: F8WIA3

Gm20604, Predicted gene 20604, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20604F8WIA3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gm20604F8WIA3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20604F8WIA3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms