Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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