Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Arid4aF8VPQ2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arid4aF8VPQ2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms