Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm5592-201ENSMUST00000097044 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm37145-201ENSMUST00000193540 2756 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Tecpr2-201ENSMUST00000165978 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm15477-202ENSMUST00000143945 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 A630012P03Rik-202ENSMUST00000114854 1974 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Cyp2c54-201ENSMUST00000048959 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms