Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm8005F6YKY3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm8005F6YKY3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm8005F6YKY3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm8005F6YKY3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8005F6YKY3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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