Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm8247F6VRJ8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm8247F6VRJ8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm8247F6VRJ8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms