Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6F6VAN0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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