Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm17555F6U8B9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm17555F6U8B9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm17555F6U8B9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm17555F6U8B9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17555F6U8B9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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