Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Rnf212F6TQD1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Rnf212F6TQD1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Rnf212F6TQD1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Rnf212F6TQD1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Rnf212F6TQD1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Rnf212F6TQD1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Rnf212F6TQD1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Rnf212F6TQD1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Rnf212F6TQD1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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