Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm10477F6SW83 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm10477F6SW83 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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