Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC067074F6RXI4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms