Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29094F6Q785 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms