Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Herc6F2Z461 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms