Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms