Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb2E9Q7L1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms