Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pdzd2E9Q1M1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pdzd2E9Q1M1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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