Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms