Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm20425E9Q035 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20425E9Q035 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms