Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms