Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsf1E9PWW9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms