Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms