Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim12cD3Z3L3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms