Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms