Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc6D3YZP9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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