Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms