Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rfx8D3YU81 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rfx8D3YU81 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms