Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Phf11bB4XVQ1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Phf11bB4XVQ1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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