Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms