Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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PtprbB2RU80 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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PtprbB2RU80 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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PtprbB2RU80 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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PtprbB2RU80 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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PtprbB2RU80 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
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PtprbB2RU80 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
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PtprbB2RU80 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
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PtprbB2RU80 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
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PtprbB2RU80 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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PtprbB2RU80 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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PtprbB2RU80 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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