Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otud4B2RRE7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms