Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed5B2RPU8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms