Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms