Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H60cB1B213 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms