Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CK137956B1AYM9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms