Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfx1B1AY10 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms