Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms