Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Odf2A3KGV1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Odf2A3KGV1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms