Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Rtf1A2AQ19 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Rtf1A2AQ19 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Rtf1A2AQ19 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Rtf1A2AQ19 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Rtf1A2AQ19 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Rtf1A2AQ19 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Rtf1A2AQ19 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Rtf1A2AQ19 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtf1A2AQ19 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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