Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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