Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c4A2ANA3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms