Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam43bA2AM80 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms