Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prdm12A2AJ77 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm12A2AJ77 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms