Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms