Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc163A2AGD7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc163A2AGD7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms