Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itgb4A2A863 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb4A2A863 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms