Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms