Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms