Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3bQ9Z321 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Top3bQ9Z321 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Top3bQ9Z321 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Top3bQ9Z321 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Top3bQ9Z321 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Top3bQ9Z321 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Top3bQ9Z321 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Top3bQ9Z321 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Top3bQ9Z321 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms