Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms