Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn9Q9Z0S7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Cldn9Q9Z0S7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms